醫(yī)學(xué)實驗動物研究所成立于1980年，是中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院的專業(yè)研究所之一。研究所是從事實驗動物學(xué)和比較醫(yī)學(xué)科研與教學(xué)的專業(yè)研究所，是國內(nèi)唯一的集實驗動物和疾病動物模型資源創(chuàng)制、保種和生產(chǎn)供應(yīng)、比較醫(yī)學(xué)技術(shù)研究、及實驗動物技術(shù)培訓(xùn)于一體的研究單位，是國家級的傳染病和新藥創(chuàng)制研究的實驗動物技術(shù)平臺的承擔單位，是衛(wèi)生部人類疾病比較醫(yī)學(xué)重點實驗室和國家中醫(yī)藥局三級實驗室。研究所通過了國家實驗室認可及國際AAALAC認證。
　　研究所使命是為生物醫(yī)藥研究提供實驗動物資源、人類疾病模型資源、比較醫(yī)學(xué)分析、評價技術(shù)服務(wù)和人才培訓(xùn)，實現(xiàn)實驗動物資源、技術(shù)、信息交流和人才的支撐。
　　研究所主要研究領(lǐng)域包括：基因工程動物模型研制；人類疾病動物模型的研制；比較醫(yī)學(xué)研究；實驗動物品系的保種和供應(yīng)；實驗動物質(zhì)量檢測技術(shù)研究。

　　自成立至今共培養(yǎng)112名研究生（66名碩士，46名博士），5名博士后；定期舉辦實驗動物專業(yè)的培訓(xùn)班，每年兩次的北京地區(qū)的實驗動物上崗培訓(xùn)。積極參加中國科協(xié)主辦的科技周和科普日宣傳活動，向公眾普及了實驗動物科學(xué)知識、先進技術(shù)和理念，提高大眾對實驗動物的科學(xué)認識，增強民眾的實驗動物知識素養(yǎng)。
　　研究所是中國唯一的國家級實驗動物學(xué)和比較醫(yī)學(xué)專業(yè)研究機構(gòu)，并在以下三個方面引領(lǐng)國內(nèi)實驗動物學(xué)科的發(fā)展，是國內(nèi)實驗動物學(xué)界與國際交流的窗口。
　　（1）研究所是全國實驗動物質(zhì)量檢測中心和衛(wèi)生部質(zhì)量檢測中心的掛靠機構(gòu)，負責對全國的質(zhì)量檢測分中心提供技術(shù)支持和監(jiān)督；
　　（2）研究所是中國實驗動物學(xué)會和中國實驗動物標準化委員會的掛靠單位，是《中國實驗動物學(xué)報》和《中國比較醫(yī)學(xué)雜志》的發(fā)行單位，是全國實驗動物人才的培訓(xùn)基地；
　　（3）研究所是國家級的傳染病防治和新藥創(chuàng)制研究項目的實驗動物技術(shù)平臺承擔單位，負責提供實驗動物資源和技術(shù)服務(wù)。